Mais de 51 mil peixes já foram marcados para monitoramento de deslocamento e habitat, inclusive no Canal da Piracema. Os estudos de marcação e recaptura revelaram que ao menos 20 espécies de peixes migram centenas de quilômetros para reprodução, com destaque para o dourado (Salminus brasiliensis), o pintado (Pseudoplatystoma corruscans), a curimba (Prochilodus lineatus), o pacu (Piaractus mesopotamicus) e a piapara (Leporinus elongatus)

A Itaipu também monitora a pesca profissional artesanal em seu reservatório, que envolve cerca de 800 pescadores organizados em 12 associações. O monitoramento da pesca, iniciado em 1985, é realizado em parceria com 11 entidades e inclui dados biológicos e socioeconômicos.

A pesca no reservatório explora aproximadamente 70 espécies, com uma produção anual de cerca de 1.300 toneladas. A captura por unidade de esforço é estimada em 10 kg de pescado por pescador por dia.